跨国的审计，尤其是财务方面的审计，是注册会计师的"老大难"。原因在于，在跨国内部存在着两种不同的会计制度。一种是在美国、加拿大等西方国家普遍采用的国际会计准则（internationalaccontingstandard），另一种是由各个根据自己的实际情况制定出来的企业会计准则。
这两种会计制度的差异很大：前者强调的是客观性原则和报告的一致性；后者则注重于决策的及时性和灵活性。因此，对跨国来说，"两本账"的问题非常严重：一方面由于采用国际会计制度的很多，而且其业务往来遍及世界各个角落，所以这种差异给会计师的工作带来了很大的困难；另一方面由于每个都有自己的一套会计核算方法及程序和方法来反映自己的经济活动状况和结果。
因此可以说："一个萝卜一个坑"，很难做到相互比较和分析。为了克服这一难题并解决"一本帐"问题，注册会计师深入了解有关情况以及相关业务的背景资料并进行必要的分析后做出的判断或结论。
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